Zaprta kontinuirana fermentacija

V zaprtem kontinuiranem sistemu fermentacije se uporablja določena metoda za ohranjanje celic v bioreaktorju in nenehno povečevanje njihovega števila. Pod temi pogoji se v bioreaktorju spremenijo določeni omejevalni dejavniki, ki povzročijo večino celične smrti. Zato je v tem sistemu nemogoče ohraniti stabilno stanje. Zaprto neprekinjeno fermentacijo je mogoče spremeniti z odprto opremo za neprekinjeno fermentacijo, če se nekaj bakterijskih teles uporablja za ponovno kroženje. Druga metoda je uporaba distančnikov ali polnil, nameščenih znotraj opreme, ki omogočajo rast bakterij na vrhu, fermentacijska juha pa teče ven brez ali z zelo malo celicami.
Dializna membranska kontinuirana fermentacija je nova metoda. Za ločevanje opreme za fermentacijo uporablja organsko membrano z mikroporami. Ta membrana lahko prehaja le skozi produkte fermentacije, ne pa tudi skozi bakterijske celice. Na ta način se gojišče kontinuirano dodaja intervalu z bakterijskimi telesi v fermentacijski opremi, presnovni produkti mikroorganizmov pa nenehno odtekajo iz drugega intervala skozi dializno membrano. V nekaterih fermentacijskih procesih, ko kopičenje metabolitov v fermentacijski brozgi doseže določeno raven, bo njihovo nadaljnje kopičenje zavrto. Vendar pa lahko uporaba metode fermentacije z dializno membrano neprekinjeno dializira metabolite, pri čemer ostane malo ostankov v fermentacijski brozgi, s čimer se izboljša izkoristek proizvoda.